В настоящее время в вузе одновременно выполняется 168 кандидатских диссертаций, у каждого доктора наук (а их в КГМУ – 118) есть ученики.
Научный потенциал вуза растет, соответственно растет и его авторитет. Выпускников с кубанскими медицинскими дипломами можно встретить более чем в 50 странах мира. Об авторитете вуза свидетельствует и тот факт, что ректорское сообщество избрало ректора КГМУ Б. Ермошенко председателем Совета ректоров Краснодарского края и Республики Адыгея. Сегодня в рамках двустороннего сотрудничества и прямых партнерских отношений университет проводит совместные исследования, в т.ч. и по проблемам фармакологии, с вузами США, Австрии, Ирландии, Швейцарии, Германии Швеции, Украины. Сотрудники вуза участвуют в реализации таких международных программ, как «Разработка новой оценочной шкалы SAPS-3», «Разработка рекомендаций по диагностике и медикаментозному лечению хронической обструктивной болезни легких».