Препараты из аналогов нуклеозидов, применяемые для лечения СПИДа, часто повреждают митохондрии клеток, что вызывает увеличение содержания молочной кислоты в крови, жировую дистрофию печени, панкреатит, невриты, миозиты и дистрофию сердечной мышцы.
Для диагностики этих осложнений исследуются клетки мышц, что требует хирургического вмешательства, а это непригодно для скрининга. Группа канадских ученых определяла с помощью ПЦР количество ДНК в ядрах и митохондриях клеток крови у больных, получавших антиретровирусные препараты. Уменьшение количества ДНК в митохондриях по отношению к ядерной ДНК было признаком медикаментозного повреждения митохондрий. При отмене лечения органеллы восстанавливались. Согласно высказыванию главного консультанта по СПИДу в кантональном госпитале св. Галлена (Швейцария) Л. Вернаццы, и в других клетках организма может быть обнаружено содержание ДНК в митохондриях при лечении антиретровирусными препаратами.